Die Sicherheitsbestimmungen bei der Freisetzung genmanipulierter Organismen wurden teilweise verschärft. Zur Prüfung der Anträge auf Marktzulassung wurde eine neue Europäische Lebensmittelbehörde, die EFSA (European Food Safety Authority), gegründet. Nicht geklärt sind bislang die Fragen der Haftung und der Koexistenz. Trotzdem lässt die EU seit 2004 wieder Gen-Pflanzen zu.
Bis August 2005 lagen etwa 40 Anträge für den Import und die Verarbeitung, zum Teil auch für den Anbau der Pflanzen vor. Sechs Maissorten und eine Rapssorte wurden seit 2004 zugelassen. Trotz grober Mängel der Gen-Pflanzen und Lücken bezüglich relevanter Daten hat sich EFSA bisher sehr unkritisch verhalten. Sogar bei Gen-Saaten, die im Tierversuchen gesundheitliche Schäden auslösten, schritt die Behörde nicht ein.
Einige Beispiele für bereits geprüfte Produkte und solche, mit denen es die EFSA demnächst zu tun haben wird:


